Dal momento che non c'è limite al numero di elementi in un array in quanto tale, non dovresti avere alcun problema.. Nel caso in cui l'array sia incorporato in un documento, potresti dare un'occhiata a questi:
http://groups.google.com/group/mongodb-user/browse_thread/thread/4a7caeba972aa998?fwc=1
Filtrare i contenuti in base alle parole
http://groups.google.com/group/mongodb-user/browse_thread/thread/28ae76e5ad5fcfb5
