Dovresti impostare la data e l'ora. La colonna create_at verrà automaticamente aggiornata al timestamp corrente al momento dell'inserimento. Consulta la documentazione in Inizializzazione e aggiornamento automatici per TIMESTAMP .
La tua dichiarazione dovrebbe essere
cursor.execute("""INSERT INTO temps VALUES (%s,%s,CURRENT_TIMESTAMP)""",(avgtemperatures[0],avgtemperatures[1]))
