Ho la soluzione.
Stavo importando/esportando usando phpmyadmin. Quindi stavamo affrontando questi problemi.
Ora abbiamo provato con la riga di comando e tutto funziona senza problemi.
Usa questo per l'esportazione:
mysqldump -u username -p databasename > filename.sql
Usa questo per l'importazione:
mysql -u username -p databasename < filename.sql