MongoDB
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Node.js riutilizza il riferimento MongoDB

mydb.js :

var mongodb= require('mongodb'),
  server = new mongodb.Server('staff.mongohq.com', 10030, {
    auto_reconnect: true
  }),
  db1 = new mongodb.Db('mydb', server);


// callback: (err, db)
function openDatabase(callback) {
  db1.open(function(err, db) {
    if (err)
      return callback(err);

    console.log('Database connected');

    return callback(null, db);
  });
}

// callback: (err, collection)
function authenticate(db, username, password, callback) {
  db.authenticate(username, password, function(err, result) {
    if (err) {
      return callback (err);
    }
    if (result) {
      var collection = new mongodb.Collection(db, 'test');

      // always, ALWAYS return the error object as the first argument of a callback
      return callback(null, collection);
    } else {
      return callback (new Error('authentication failed'));
    }
  });
}

exports.openDatabase = openDatabase;
exports.authenticate = authenticate;

use.js :

var mydb = require('./mydb');
// open the database once
mydb.openDatabase(function(err, db) {
  if (err) {
    console.log('ERROR CONNECTING TO DATABASE');
    console.log(err);
    process.exit(1);
  }

  // authenticate once after you opened the database. What's the point of 
  // authenticating on-demand (for each query)?
  mydb.authenticate(db, 'usernsame', 'password', function(err, collection) {
    if (err) {
      console.log('ERROR AUTHENTICATING');
      console.log(err);
      process.exit(1);
    }

    // use the returned collection as many times as you like INSIDE THE CALLBACK
    collection.find({}, {limit: 10})
    .toArray(function(err, docs) {
      console.log('\n------ 1 ------');
      console.log(docs);
    });

    collection.find({}, {limit: 10})
    .toArray(function(err, docs) {
      console.log('\n------ 2 ------');
      console.log(docs);
    });
  });
});

Risultato:

sul successo:

in caso di fallimento:

[Risposta originale]:

Stai aprendo il db più volte (una volta in ogni query ). Dovresti aprire il database solo una volta e usare il db oggetto nella richiamata per un uso successivo.

Stai utilizzando lo stesso nome di variabile più volte e ciò potrebbe aver creato un po' di confusione.

var mongodb = require('mongodb'),
    server = new mongodb.Server('staff.mongohq.com', 10030, {
        auto_reconnect: true
    }),
    db1 = new mongodb.Db('mydb', server);

function authenticateAndGo(db, handle) {
    db.authenticate('username', 'password', function(err) {
        if (err) {
            console.log(err);
            return;
        }
        console.log('Database user authenticated');

        var collection = new mongodb.Collection(db, 'test');

        handle(collection);
    });
}

function query(handle) {
    db1.open(function(err, db2) {
        if( err ) {
            console.log(err);
            return;
        }
        console.log('Database connected');

        authenticateAndGo(db2, handle);
    });
};
exports.query = query;

Ho leggermente modificato il codice sopra (db1 per il db originale, db2 per gli aperti db). Come puoi vedere, stai aprendo db1 più volte, il che non va bene. estrai il codice per l'apertura in un altro metodo e usalo UNA VOLTA e usa il db2 esempio per tutte le tue domande/aggiornamenti/rimozioni/...