Come ha detto Kane, il CTE è disponibile solo nell'istruzione SQL in cui è scritto. Un'altra possibile soluzione, a seconda delle specificità della tua situazione, sarebbe quella di includere il COUNT(*) nella singola query:
;WITH MyBigProducts AS
(
SELECT
Name,
COUNT(*) OVER () AS total_count
FROM
Products
WHERE
Size = 'Big'
)
SELECT
Name,
total_count
FROM
MyBigProducts