Usa FIND_IN_SET()
per cercare un elemento di un elenco separato da virgole.
$lsc_adminid_query = xtDBquery("
SELECT lsc.option_id
FROM lsc_config lsc
WHERE FIND_IN_SET({$_SESSION['customer_id']}, lsc.option_value)");
Ma sarebbe meglio normalizzare il tuo progetto in modo da non avere elenchi separati da virgole nelle colonne del database in primo luogo.