Mysql
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Aggiorna più colonne per più righe in una query di SQL

prova questo

 update user
 set ext_flag = 'Y', admin_role = 'admin', ext_id = 
 case 
 when user_id = 2 then 345
 when user_id = 4 then 456
 when user_id = 5 then 789
 end
 **WHERE user_id  in (2,4,5)**