Mysql
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Aggiorna più tabelle in una singola query in MySQL

Puoi provare sotto il codice:

UPDATE tab1, tab2, tab3
SET tab1.a = '', tab2.b = '',tab3.c = ''
WHERE tab1.id = 3 AND tab2.id = 9 AND tab3.id = 5;

AGGIORNAMENTO:

Come menzionato da OP, il codice non funziona per Mysql 5.5 , sotto codice aggiunto

UPDATE tab1 a 
  INNER JOIN tab2 b ON (a.id = b.id)
  INNER JOIN tab3 c ON (a.id = c.id)
SET tab1.a = '', tab2.b = '', tab3.c = ''
WHERE a.id = 3 AND tab2.id = 9 AND tab3.id = 5;