L'ho fatto in diverse implementazioni usando un metodo come il seguente. Fallo su UserModel e non a livello di UserEntity.
void updateRoles(UserModel user, List<RoleModel> rolesToRemove, List<RoleModel> rolesToAdd)
{
for (RoleModel role : rolesToRemove)
{
user.deleteRoleMapping(role);
}
for (RoleModel role : rolesToAdd)
{
user.grantRole(role);
}
}