Come migliorare l'ordine in base alle prestazioni con i join in mysql

Prova a sbarazzarti del distinct . Questo è un killer di prestazioni. Non sono sicuro del motivo per cui la tua prima query funziona rapidamente; forse MySQL è abbastanza intelligente da ottimizzarlo.

Ci proverei:

SELECT tt.id
FROM tracked_twitter tt
WHERE EXISTS (SELECT 1
              FROM twitter_content tc INNER JOIN  
                   tracker_twitter_content ttc
                   ON  tc.id =  ttc.twitter_content_id
              WHERE  ttc.tracker_id =  88 AND
                     tt.id =  tc.tracked_twitter_id
             )
ORDER BY tt.followers_count DESC ;

Per questa versione, desideri indici su:tracked_twitter(followers_count, id) , twitter_content(tracked_twitter_id, id) e tracker_twitter_content(twitter_content_id, tracker_id) .