Secondo una delle risposte a questo domanda, il tuo problema potrebbe essere causato da modifiche in MySQL 5.6 (consulta le note di InnoDB su http://dev.mysql.com/doc/relnotes/mysql/5.6/en/news-5-6-20.html ):
Aiuta se modifichi innodb_log_file_size a qualcosa di più grande di 50M? (La modifica di quella variabile richiede alcuni passaggi per funzionare correttamente:
