Puoi modificare il main_menu.xml file (per me su Ubuntu 12.04 questo era in /usr/share/mysql-workbench/data/ ). Dopo averlo modificato, dovrai riavviare MySQL Workbench.
Sembrerà così
<value type="object" struct-name="app.MenuItem" id="com.mysql.wb.menu.query.exec">
<link type="object" key="owner" struct-name="app.MenuItem">com.mysql.wb.menu.query</link>
<value type="string" key="caption">Execute (All or Selection)</value>
<value type="string" key="name">query.execute</value>
<value type="string" key="command">builtin:query.execute</value>
<value type="string" key="itemType">action</value>
<value type="string" key="shortcut">Modifier+E</value>
</value>
La penultima riga (Modifier+E) è stata modificata da me. In precedenza diceva "Modificatore + Maiusc + Invio". Nota che questo NON è un alias (non puoi avere entrambi).
