Se riscontri problemi con la compilazione dell'estensione binaria o su una piattaforma in cui non puoi, puoi provare a utilizzare python puro PyMySQL
attacchi.
Semplicemente pip install pymysql
e cambia il tuo URI SQLAlchemy per iniziare in questo modo:
SQLALCHEMY_DATABASE_URI = 'mysql+pymysql://.....'
Ci sono alcuni altri driver potresti anche provare.