Suggerirei di dimenticare il file bat e di farlo manualmente:
- Vai alla tua cartella xampp\mysql\bin\
- Modifica mio.ini e inserisci
skip-grant-tables
sotto[mysqld]
- Riavvia MySQL
- Imposta una nuova password per il tuo utente root eseguendo
UPDATE mysql.user SET Password=PASSWORD('new_password') WHERE User='root'
in phpMyAdmin in mysql database (o lascialo così se non è possibile accedere a MySQL da host remoti)