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cos'altro mi serve oltre a $cfg['Servers'][$i]['ssl']=TRUE

È tutto spiegato ragionevolmente bene nel manuale; queste opzioni sono configurate tramite direttive aggiuntive in config.inc.php.

Vedi ad esempio http://docs.phpmyadmin.net/en/latest/ config.html#cfg_Servers_ssl e i pochi paragrafi che seguono. (Oppure, per essere più precisi, vedi

Nel mio caso, sono riuscito a raggiungere questo obiettivo aggiungendo queste direttive:

$cfg['Servers'][$i]['ssl'] = true;
$cfg['Servers'][$i]['ssl_cert'] = '/etc/mysql/client-cert.pem';
$cfg['Servers'][$i]['ssl_ca'] = '/etc/mysql/ca-cert.pem';
$cfg['Servers'][$i]['ssl_key'] = '/etc/mysql/client-key.pem';

Adeguamento ovviamente per i percorsi corretti sul tuo sistema locale. Buona fortuna!