Ho appena trovato la risposta in questo thread:PHPMyAdmin - Il conteggio totale dei record varia
Sembra che l'aggiunta di un parametro di configurazione in config.inc.php serva al trucco:http://www.kavoir.com/2012/07/make-phpmyadmin-show-exact-number-of-records-for-innodb-tables.html
Basta aggiungere questa riga in config.inc.php:
$cfg['MaxExactCount'] = 2000000;
In modo che qualsiasi tabella InnoDB con meno di 2000000 righe abbia un numero esatto di righe visualizzate.
Rendi questo numero abbastanza grande e tutte le tabelle InnoDB nel tuo database avranno un numero esatto di righe nella pagina del database phpMyAdmin.