Cambia l'SQL che phpmyadmin eseguirà in questo:
LOAD DATA INFILE '*FILEPATH*'
INTO TABLE *table*
(X, Y);
(Dovrai solo cambiare l'ultima riga) E il tuo csv dovrebbe assomigliare a
-105.057578,39.785603
-105.038646,39.771132
-105.013045,39.771727
-105.045721,39.762055
-105.031777,39.76206
-105.046015,39.72835
L'ultima riga dice a MySQL di cercare solo quelle due colonne di dati e di inserire null per qualsiasi altra colonna. Il valore NULL verrà incrementato automaticamente come previsto.