Aggiungi i valori dell'array in MongoDB dove l'elemento non è nell'array

Puoi provare con bulkWrite operazione in mongodb

Account.bulkWrite(
  req.body.accountTemplates.map((data) => 
    ({
      updateOne: {
        filter: { _id: req.account._id, 'templates.name' : { $ne: data.name } },
        update: { $push: { templates: { $each : data } } },
        upsert : true
      }
    })
  )
})