Sono nella stessa identica situazione, ho seguito esattamente gli stessi passaggi e ho avuto lo stesso problema.
Ciò che ha funzionato per me è stato:
sudo service mongod stop
sudo apt-get purge mongodb-org*
NON rimuovere le directory di dati - in tal caso, tutti i tuoi dati andranno persi.
Nota:chiamando sudo apt-get purge mongodb-org* cancella il mongod.conf file. Nel caso in cui desideri conservare questo file dopo l'aggiornamento, assicurati di creare una copia di backup di esso e utilizzarlo dopo l'installazione della nuova versione.
Quindi installa mongodb con:
sudo apt-get install -y mongodb-org
Ciò presuppone che tu abbia già eseguito i passaggi di installazione precedenti (importazione della chiave pubblica, creazione di un file di elenco, ricarica del database del pacchetto locale) come hai affermato.
