Non conosco il driver Java, ma devi creare un elenco lì? Cosa succede se provi questo codice?
BasicDBObject update = new BasicDBObject().append("$push", new BasicDBObject().append("values", dboVital));
update = update.append("$set", new BasicDBObject().append("endTime", time));
collection.update( new BasicDBObject().append("_id", pageId), update, true, false);
Questo dovrebbe produrre l'equivalente di
db.collection.update({_id: pageId}, {$push: {values: dboVital}, $set: {endTime: time}});
Mentre il tuo codice produce (sospetto) questo:
db.collection.update({_id: pageId}, [{$push: {values: dboVital}}, {$set: {endTime: time}}]);