Due motivi:
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Ogni ObjectId viene generato localmente sul client. I diversi client non stanno coordinando i valori che stanno generando. Pertanto è possibile che ci sono due client che generano gli stessi numeri casuali e quindi genererebbero esattamente gli stessi ObjectId. Altamente improbabile ma possibile, quindi dicitura "probabilmente unica".
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Algoritmo di generazione ObjectId specifica l'uso di un contatore a 3 byte che viene utilizzato per disambiguare i valori generati nello stesso secondo. Se generi più di 16 milioni di ObjectId nello stesso secondo, quel contatore andrà in overflow e il client che stai utilizzando inizierà a generare ObjectId che ha già generato un momento fa.