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Spring Data MongoDB elimina i POJO

Non penso che tu possa farlo senza un pojo quando usi i dati di primavera. Il minimo che potresti fare è questo

public interface NoPojoRepository extends MongoRepository<DummyPojo, String> {
}

e crea un pojo fittizio con solo id e una mappa.

@Data
public class DummyPojo {
  @Id
  private String id;
  private Map<String, Object> value;
}

Poiché questo campo valore è una mappa, puoi memorizzare praticamente qualsiasi cosa.