Esistono diversi modi per spiegare come pymongo può funzionare (o fallire) con mod_wsgi, suggeriti qui:http://api.mongodb.org/python/current/faq.html?highlight=wsgi#does-pymongo-work-with-mod-wsgi
Inoltre puoi utilizzare una sorta di soluzione di pooling, come descritto qui:http://www.mongodb.org/display/DOCS/Notes+on+pooling+for+Mongo+Drivers
Un progetto che so già avere in pool è MongoEngine , è un ORM molto semplice che usa pymongo dietro le quinte. Potresti voler esaminarlo insieme alle soluzioni faq di pymongo sopra.