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mangusta cursore batchSize

Prova questo:

var myCursor = collection.find({}).cursor({batchSize:50});
myCursor.eachAsync((doc) => {
   ...
});

Le dimensioni dei lotti servono solo per l'ottimizzazione delle prestazioni e non ti daranno un blocco di 50 oggetti.

Dovrai comunque elaborare ogni documento singolarmente.