L'aggiunta delle seguenti righe prima dell'uscita 0 nel file /etc/rc.local con privilegi di root ha fatto la magia. Riavviato il sistema operativo dopo aver salvato il file. Quindi gli avvisi sono scomparsi nella mongo shell.
Fonte:documentazione MongoDB(http ://docs.mongodb.org/manual/reference/transparent-huge-pages/#transparent-huge-pages-thp-settings )
if test -f /sys/kernel/mm/transparent_hugepage/khugepaged/defrag; then
echo 0 > /sys/kernel/mm/transparent_hugepage/khugepaged/defrag
fi
if test -f /sys/kernel/mm/transparent_hugepage/defrag; then
echo never > /sys/kernel/mm/transparent_hugepage/defrag
fi
if test -f /sys/kernel/mm/transparent_hugepage/enabled; then
echo never > /sys/kernel/mm/transparent_hugepage/enabled
fi