Devi importare il codec DBRef per stamparlo, se lo vuoi in un documento in stile json devi scrivere il tuo codec per DBRef e aggiungerlo al codecregistry che dai a Json().
es.
CodecRegistry codecRegistry = MongoClientSettings.getDefaultCodecRegistry();
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final DocumentCodec codec = new DocumentCodec(codecRegistry, new BsonTypeClassMap());
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System.out.println(document.toJson(codec));