Autore di MongoEngine qui - MongoEngine è basato su pymongo quindi ovviamente puoi entrare in pymongo - o usare pymongo grezzo nel tuo codice!
Esistono alcuni helper per i documenti che ti consentono di accedere ai metodi pymongo grezzi in MongoEngine, ad esempio:
class Person(Document):
name = StringField()
# Access the pymongo collection for the Person document
collection = Person._get_collection()
collection.find_one() # Use raw pymongo to query data