Sembra DbFunctions.CreateTime
è quello che stai cercando:
Quindi, per ottenere risultati tra due volte, puoi:
var timeCapturesQuery = Context.TimeCaptures.Where(t =>
DbFunctions.CreateTime(t.StartDateTime.Hour, t.StartDateTime.Minute, t.StartDateTime.Second) < endTime &&
DbFunctions.CreateTime(t.EndDateTime.Hour, t.EndDateTime.Minute, t.EndDateTime.Second) > startTime);