Ho avuto lo stesso problema su Arch Linux. Penso che non sia un problema dipendente dal sistema operativo. Ad ogni modo, l'ho risolto trovando i pacchetti obsoleti e aggiornandoli quindi.
pip uninstall psycopg2
pip list --outdated
pip install --upgrade wheel
pip install --upgrade setuptools
pip install psycopg2
spero che questo aiuti...
