Soluzione:
Per coloro che hanno riscontrato lo stesso problema, ecco cosa ho trovato. Ho eseguito show variables like 'datadir' e ho scoperto che i miei file di dati sono archiviati in una cartella diversa:C:\ProgramData\MySQL\MySQL Server 5.5\data\
e inizialmente stavo sostituendo i file nella cartella C:\Programmi.... Erano presenti anche i file necessari.
Quindi alla fine è andato tutto bene.
