assicurati che l'indirizzo IP della tua macchina locale, da cui stai tentando di accedere a mysql tramite VPN, abbia i privilegi per accedere al database.
mysql> select host,user,password from mysql.user;
+------+------+-------------------------------------------+
| host | user | password |
+------+------+-------------------------------------------+
| % | abcd | *9B3E7610FB431631340BD618E58D49DF1928A251 |
| % | sync | *1747319F3F87039C382597515F8742920D9B75D1 |
| % | root | *FAAFFE644E901CFAFAEC7562415E5FAEC243B8B2 |
+------+------+-------------------------------------------+
Assicurati che ci sia una voce per l'indirizzo IP della macchina locale per l'utente attraverso il quale stai effettuando l'accesso. Puoi anche usare % nel campo host. % indica tutti gli utenti.
Puoi aggiungere privilegi tramite il seguente comando
mysql> grant all on *.* to 'root'@'%' identified by <password>.
mysql> flush privileges
