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Come verificare se la colonna non esiste utilizzando PHP, PDO, MySQL?

Non so se ti aiuta, ma puoi provare questo:

if (count($dbh->query("SHOW COLUMNS FROM `items` LIKE 'item_type'")->fetchAll())) {
    $sth = $dbh->query ("SELECT item_type FROM items WHERE user_id = '$user_id'");
    $row = $sth->fetch();
    $item_type = $row['item_type'];
} else {
    $item_type = null;
}

Verifica se la colonna esiste ed esegue l'operazione.