Se ho capito correttamente la tua domanda, per rispondere alla parte per restituire solo una direzione, prova la query seguente:
SELECT d1.*
FROM train_schedule d1
INNER JOIN train_schedule d2 ON d2.train_no=d1.train_no
WHERE d1.stn_code = 'JU' and d2.stn_code = 'JP'
AND d1.distance < d2.distance
JU (partenza) avrà sempre una distanza inferiore a JP (arrivo).