Errore durante l'esecuzione dello script SQL; Il processo non può accedere al file perché è utilizzato da un altro processo:'C:\\Users\\......\....cnf'

ho il tuo stesso errore, sono riuscito a risolverlo da me seguendo questi passaggi:

1. Invece di eseguire "esegui script sql", esegui "apri script sql"
2. Dopo l'apertura dello script, esegui tutto (il fulmine btn accanto all'icona di salvataggio)

Spero che funzioni anche per te!