Prova ad aumentare il numero predefinito di thread IO se stai utilizzando il motore InnoDB. Il valore predefinito di RDS è un misero 4. Sarà necessario riavviare l'istanza database affinché il gruppo di parametri utilizzi i nuovi valori poiché non sono "dinamici" (richiede un riavvio).
show variables like 'innodb_%io_threads';
+-------------------------+-------+
| Variable_name | Value |
+-------------------------+-------+
| innodb_read_io_threads | 4 |
| innodb_write_io_threads | 4 |
+-------------------------+-------+
