Guarda l'uso di CNAME. Convincere gli utenti a creare CNAME personalizzati sui loro record DNS e fare in modo che il tuo sito tenti di accedervi è un modo per verificare la proprietà di un dominio.
Un altro sarebbe un po' più di lavoro, ma far sì che gli utenti aggiungano un Meta tag al loro sito e di nuovo che la tua pagina tenti di accedere e leggere queste informazioni Meta per dimostrare che hanno accesso alla pagina, verificando così la proprietà.
AGGIORNAMENTO:
dns-get-record