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Come posso aumentare la velocità di questa analisi dei dati?

Non mostri la struttura della tua chiave, anche se mostra quel site_id fa parte di una chiave multiparte (MUL ). nota che se non è il PRIMO campo in quella chiave multiparte, la chiave non può essere utilizzata per quella clausola where. ad esempio se hai

KEY somekey (field1, site_id, field3, ...)

quindi la tua clausola where deve includere ENTRAMBI i field e site_id affinché quella chiave sia utilizzabile nella query. Non è necessario utilizzare i campi nello stesso ordine in cui sono elencati nella chiave (where site_id=.. and field1=... funzionerà come where field1=... and site_id=... ), ma poiché field1 viene visualizzato prima di site_id nella definizione della chiave, è necessario utilizzarlo anche affinché l'intera chiave sia utilizzabile.

Lo stesso vale per il tuo q campo. Deve anche essere il primo nelle chiavi da coprire, altrimenti quelle chiavi sono inutilizzabili.