Utilizzo di COUNT in GROUP_CONCAT

Devi COUNT() con GROUP BY in un SELECT interno prima la clausola e poi applica GROUP_CONCAT();

SELECT GROUP_CONCAT(cnt) cnt
FROM (
    SELECT COUNT(*) cnt
    FROM table1
    GROUP BY fk_company
) q;

Uscita:

|   CNT   |
-----------
| 3,2,3,1 |

Ecco SQLFiddle demo.