Non ci sono strumenti speciali per farlo. Puoi semplicemente concatenare i file:
$ cat b1.sql b2.sql b3.sql > b_all.sql
Tranne che il contenuto tipico di questi file .sql è una DROP TABLE, quindi una CREATE TABLE, quindi molte istruzioni INSERT. Se ciascuno dei singoli file di dump è formattato in questo modo, se li ripristini in sequenza, ciascuno DROP TABLE e cancellerà i dati importati dal file precedente.
Puoi creare un file dump senza le istruzioni DROP/CREATE:
$ mysqldump --no-create-info <database> <table> ...
Ma se hai già i file di dump (non puoi scaricarli nuovamente) e vuoi sbarazzarti delle istruzioni DROP/CREATE in tutto tranne il primo file:
$ ( cat b1.sql ; cat b2.sql b3.sql | sed -e '/^DROP TABLE/,/^-- Dumping data/d' ) > b_all.sql