L'inserimento negli indici in generale interrompe le prestazioni. Potrebbe essere meglio rimuovere l'indice prima di inserire i dati e reindicizzarlo dopo l'inserimento.
Da http://forum.percona.com/s/m/983/ :
Dai un'occhiata anche a http:/ /www.mysqlperformanceblog.com/2007/05/24/predicting-how-long-data-load-would-take/ e http://www.linuxtopia.org/online_books/ database_guides/mysql_5.1_database_reference_guide/insert-speed.html .
