MYSQL ultimo accesso e numero di accessi negli ultimi 3 mesi

Per prima cosa risolvi ogni problema separatamente:

SELECT A.UserID, MAX(TIME) AS LastLogin  
FROM UserMaster A  
LEFT JOIN UserWebActivity B
ON A.UserID = B.UserID  
AND Activity = 'Login'  
GROUP BY A.UserID

SELECT A.UserID, COUNT(Activity) AS Logins
FROM UserMaster A  
LEFT JOIN UserWebActivity B ON A.UserID = B.UserID  
AND Activity = 'Login'  
AND TIME BETWEEN (NOW() - INTERVAL 3 MONTH) AND NOW( )  
GROUP BY A.UserID

Testali separatamente per assicurarti che ciascuna di queste query funzioni come desideri e modificale se necessario.

Quindi, quando sei felice che entrambi funzionino, unisci i risultati:

SELECT T1.UserID, T1.LastLogin, T2.Logins
FROM
(
    SELECT A.UserID, MAX(TIME) AS LastLogin  
    FROM UserMaster A  
    LEFT JOIN UserWebActivity B
    ON A.UserID = B.UserID  
    AND Activity = 'Login'  
    GROUP BY A.UserID
) AS T1
JOIN
(
    SELECT A.UserID, COUNT(Activity) AS Logins
    FROM UserMaster A  
    LEFT JOIN UserWebActivity B
    ON A.UserID = B.UserID  
    AND Activity = 'Login'
    AND TIME BETWEEN (NOW() - INTERVAL 3 MONTH) AND NOW()
    GROUP BY A.UserID
) AS T2
ON T1.UserID = T2.UserID

Ciò consentirà a MySQL di utilizzare al meglio gli indici per le diverse query.