Hai alcuni modi per farlo, ma cercando di non creare tabelle temporanee, puoi fare qualcosa del genere:
select
s.id,
avg(case when sb.id = '01' then s.score end) as math,
avg(case when sb.id = '02' then s.score end) as bio
from student s
join subject sb on (sb.id = s.subject_id)
group by s.id
Basta riempire le righe somma/caso agli altri soggetti di cui hai bisogno!
Spero che aiuti.