Abbiamo iniziato ad avere lo stesso problema "Collegamento di comunicazione" quando abbiamo aggiornato l'ibernazione a 4.3.x utilizzando JPA e C3P0 per il pool di connessioni.
Sembra che questo sarebbe un problema di pool di connessioni poiché le connessioni venivano mantenute più a lungo del database wait_timeout
(che erano le 8 ore predefinite) nonostante le mie impostazioni C3P0. Tuttavia, ho risolto il problema modificando la configurazione di ibernazione nel nostro persistence.xml
con:
<property name="hibernate.connection.release_mode" value="after_transaction" />
Sembra che il comportamento predefinito in ibernazione sia cambiato per non rilasciare la connessione dopo le transazioni, quindi devi impostare esplicitamente questa modalità se stai usando il pool.