Puoi usare il -m opzione per specificare un file che contiene un comando da eseguire sulla connessione remota.
Esempio:
C:\Progra~1\Putty\putty.exe -ssh -m C:\cmd.txt example@sqldat.com
Contenuto di C:\cmd.txt
mysql -u USER -pPASS db < /tmp/dump.sql
Dalla documentazione Putty :
