Il sito che hai collegato contiene tutte le informazioni necessarie:
Il innodb_ft_min_token_size
non è una variabile dinamica
quindi dovrai cambiare il file di configurazione my.cnf
e aggiungi innodb_ft_min_token_size=6
. In alternativa è necessario modificare il comando di avvio del server MySQL.
Dopo la modifica è necessario riavviare il server MySQL.