MySql Inner Join con clausola WHERE

Si hai ragione. Hai inserito WHERE clausola sbagliata. Puoi usare solo un WHERE clausola in una singola query, quindi prova AND per più condizioni come questa:

 SELECT table1.f_id  FROM table1 
   INNER JOIN table2
     ON table2.f_id = table1.f_id
 WHERE table2.f_type = 'InProcess'
   AND f_com_id = '430'
   AND f_status = 'Submitted'