Se la versione del client/server MySQL è una 5.6.x, un modo per evitare il messaggio di AVVISO è utilizzare mysql_config_editor strumenti:
mysql_config_editor set --login-path=local --host=localhost --user=username --password
Quindi puoi usare nel tuo script di shell:
mysql --login-path=local -e "statement"
Invece di:
mysql -u username -p pass -e "statement"