Meglio più tardi che mai )
Se stai usando codice prima e classi di mappatura manuale, usa la configurazione HasColumnType ("INT") per le proprietà int.
Ad esempio:
var entity = builder.Entity<APP_TABLE>();
entity
.HasKey(x => x.ID)
.ToTable("APP_TABLE", "SCHEMA");
entity
.Property(x => x.ID)
.HasColumnType("INT");