Come inserire un array dinamico nel database in php?

Devi spostare la tua query fuori dal ciclo foreach. Ecco un modo per farlo -

$Voltage = array();
$Duration = array();
$Number = array();

foreach($asma as $key => $value) 
{

   foreach ( $value as $ind => $hObject ) {
      $Voltage[] = $hObject->Voltage;
      $Duration[] = $hObject->Duration;
      $Number[] = $hObject->Number;               ,
   }

} // endforeach
$q = "INSERT INTO ga (fe, fe1, fe2,fe3,fe4,fe5,fe6,f7,f8, timestamp,username ) VALUES (%d, %d, %d,%d, %d, %d,%d, %d, %d, '%s' ,'$login_session')";
$qs = sprintf( $q, $Voltage[0],$Duration[0],$Number[0],
                   $Voltage[1],$Duration[1],$Number[1],
                   $Voltage[2],$Duration[2],$Number[2],
                   date("Y-m-d H:i:s") );
$result = mysql_query($qs);
if ( ! $result ) {
     die( 'Insert failed ' . mysql_errno() . ' ' . mysql_error() );                
}

modifica

per aggiungere una seconda riga, puoi cambiarla in qualcosa del genere (nota, non vedo dove stai definendo la selezione per 1/2, quindi metto solo $user_select ) -

$Voltage = array();
$Duration = array();
$Number = array();

foreach($asma as $key => $value) 
{

   foreach ( $value as $ind => $hObject ) {
      $Voltage[] = $hObject->Voltage;
      $Duration[] = $hObject->Duration;
      $Number[] = $hObject->Number;               ,
   }

} // endforeach
$q = "INSERT INTO ga (fe, fe1, fe2,fe3,fe4,fe5,fe6,f7,f8, timestamp,username ) VALUES (%d, %d, %d,%d, %d, %d,%d, %d, %d, '%s' ,'$login_session')";
$qs = sprintf( $q, $Voltage[0],$Duration[0],$Number[0],
                   $Voltage[1],$Duration[1],$Number[1],
                   $Voltage[2],$Duration[2],$Number[2],
                   date("Y-m-d H:i:s") );
if($user_select==2){  // if user select 2
    $q = ", (%d, %d, %d,%d, %d, %d,%d, %d, %d, '%s' ,'$login_session')";
    $qs = sprintf( $qs.$q, $Voltage[3],$Duration[3],$Number[3],
                             $Voltage[4],$Duration[4],$Number[4],
                             $Voltage[5],$Duration[5],$Number[5],
                             date("Y-m-d H:i:s") );
}
$result = mysql_query($qs);
if ( ! $result ) {
     die( 'Insert failed ' . mysql_errno() . ' ' . mysql_error() );                
}

modifica n. 2
ecco un'altra versione. Il tuo ciclo for non è valido php for(i=0;i<row_count;i++) . ognuno di questi dovrebbe avere un $ - for($i=0;$i<$row_count;$i++) . Inoltre, il tuo sprintf ha la quantità sbagliata di variabili. Nel tuo $q hai 9 %d , ma in $qs ne dai solo 3. Da dove ti aspetti che provengano gli altri 6. In questo ho cambiato il tuo ciclo per aumentare di 3 - for($i=0;$i<$row_count;$i+=3) e usato $Voltage[$i+1], $Duration[$i+1], $Number[$i+1], $Voltage[$i+2], $Duration[$i+2], $Number[$i+2], per compilare i restanti 6 %d s

$Voltage = array();
$Duration = array();
$Number = array();

foreach($asma as $key => $value) 
{

   foreach ( $value as $ind => $hObject ) 
   {
      $Voltage[] = $hObject->Voltage;
      $Duration[] = $hObject->Duration;
      $Number[] = $hObject->Number;               

} }// endforeach
for($i=0;$i<$row_count;$i+=3)
{

  $q = "INSERT INTO ga (fe, fe1, fe2,fe3,fe4,fe5,fe6,f7,f8, timestamp,username ) VALUES (%d, %d, %d,%d, %d, %d,%d, %d, %d, '%s' ,'$login_session')";
  $qs = sprintf( $q, $Voltage[$i],$Duration[$i],$Number[$i],
                     $Voltage[$i+1],$Duration[$i+1],$Number[$i+1],
                     $Voltage[$i+2],$Duration[$i+3],$Number[$i+3],

                   date("Y-m-d H:i:s") );
  $result = mysql_query($qs);
  if ( ! $result ) {
     die( 'Insert failed ' . mysql_errno() . ' ' . mysql_error() );                
 }}}
?>