Alla fine l'ho trovato.
Apparentemente, si sono verificati alcuni problemi di incompatibilità dopo l'aggiornamento a MySQL 5.6.
Per verificare la presenza di tali problemi e risolverli, dovrai eseguire un aggiornamento a MySQL.
Basta eseguire quanto segue su un terminale:
mysql_upgrade -u root -p
Inserisci la tua password e attendi fino al termine dell'aggiornamento.
Questo ha risolto il problema per me.
